于根伟参加了2002年的韩日世界杯。在2001年的世界杯亚洲区预选赛中，正是他的关键进球，帮助中国队战胜阿曼，提前两轮闯入世界杯决赛圈。在世界杯决赛圈的比赛中，于根伟并未获得太多表现机会。

于根伟是天津人，一生只效力于一支球队，那就是家乡球队天津泰达，他也因此被誉为天津足球的旗帜。于根伟在球场上司职前锋，他速度快，突破能力强，并且有着细腻的技术，是一名十分优秀的前锋球员。但伤病成为了他职业生涯中的一大阻碍，他曾多次入选中国国家队，其中有好几次因为伤病而不得不选择退出。在前往南美洲治疗腿上期间，他还曾被乌拉圭球队佩纳鲁尔看中，并向他投来了橄榄枝，然而他出于天津队前景考虑，最终放弃了刘洋的机会。

他职业生涯最高光的时刻莫过于2001年的世界杯预选赛中，他在沈阳五里河体育场打进一球，使得中国队以1：0的比分拿下阿曼队，正是凭借着这粒进球，中国队历史上首次闯入世界杯决赛圈。这是载入中国足球史册的时刻，也是中国足球历史上最伟大的瞬间。

在世界杯决赛圈的比赛中，于根伟在球队里担任替补的角色，他仅仅在第一场小组赛对阵哥斯达黎加的比赛中以及第三场小组赛对阵土耳其的比赛中替补出场，一共获得了约30分钟的出场时间，未取得进球和助攻。而中国的队的首次世界杯之旅也以小组赛出局而告终。